Seit dem Jahr 2005 hat WACKER einen Pandemie-Vorsorgeplan. Er minimiert im Krisenfall gesundheitliche Risiken für die Mitarbeiter und Auswirkungen auf die Geschäftsprozesse. Auch wann und wie ein zentraler Krisenstab im Ernstfall weltweit alle Maßnahmen steuert, legt der Pandemieplan fest. Er regelt den Umgang mit erkrankten oder exponierten Mitarbeitern, Reisen in betroffene Regionen und Zutrittskontrollen an den einzelnen Standorten. WACKER verfügt über einen Vorrat an Grippemedikamenten und an Hilfsmitteln wie Gesichtsmasken, Handschuhen und Desinfektionsmitteln, die im Pandemiefall an die Mitarbeiter verteilt werden.
Im Jahr 2009 wurde neben der saisonalen Grippeimpfung auch eine Impfung gegen die so genannte Schweinegrippe (H1N1) angeboten. Wegen der geringen Nachfrage der Belegschaft wurden im Wesentlichen die Einsatzkräfte des Gesundheitsdienstes und der Feuerwehr geimpft.